Les expositions du Vaisseau ont été conçues par Universcience, lauréat d’un concours européen. La grande majorité des éléments a été conçue spécifiquement pour le Vaisseau.
- L’espace d’exposition permanente se divise en cinq univers dont quatre à l’intérieur du Vaisseau (pour une surface de 2 000 m²) et un jardin pédagogique de 5 000 m². Afin de toujours mieux satisfaire l’attente de ses publics, le Vaisseau s’est lancé dans le renouvellement des éléments de son exposition permanente. Les premiers résultats de ce renouvellement seront présentés à l’automne 2010.
- Le Vaisseau présente une ou deux fois par an une nouvelle exposition intéractive dans sa salle d’exposition temporaire.Devant le succès de ces manifestations, le Conseil Général du Bas-Rhin a décidé de financer une extension de 375 m² de la zone dédiée à la médiation scientifique et aux expositions temporaires. Les travaux débuteront au cours du second semestre 2011 et s’achèveront fin 2012.